Yksi Vihreän lipun pääperiaatteista on ympäristökuormituksen vähentäminen. Jokaista teemaa työstettäessä suunnitellaan ja kootaan ne uudet ympäristömyönteiset toimintatavat, joiden noudattamiseen kaikki sitoutuvat. Näitä toimintatapoja kutsutaan Vihreä lippu -tavoiksi. Näiden ympäristömyönteisten tapojen kirjaaminen, noudattaminen ja kehittäminen (englanniksi Eco-Code), on osa Eco-Schools -ohjelman kansainvälisiä kriteereitä, joita toteutetaan kaikissa ohjelmaan osallistuvissa maissa.

Vihreä lippu -tavat liittyvät kulloisenkin projektin teemaan, mutta ne jäävät pysyviksi toimintatavoiksi, joita noudatetaan projektin jälkeenkin. Jokaisen uuden projektin myötä Vihreä lippu -tapojen listaa päivitetään yhä kattavammiksi. Vihreä lippu -tapojen tulee olla selkeä ja mielellään hauskakin ohjeistus, jonka kaikki tuntevat. Mielikuvitusta saa käyttää! Vihreä lippu -tavat voivat olla kirjattuina esim. julisteen, runon, laulun tai sarjakuvan muotoon. Vihreä lippu -tapojen tulee olla kaikkien nähtävillä yhteisissä tiloissa tai muulla tavalla esillä jatkuvasti.

Turkulainen Pernontien päiväkoti voitti Suomen Ympäristökasvatuksen Seuran syksyllä 2009 järjestämän Vihreä lippu -tavat -kilpailun. Pernontien päiväkodin Vihreä lippu -tavat eli päiväkodissa käytössä olevat ympäristömyönteiset toimintatavat ovat esillä seinille askarreltujen puiden lehtinä. Lisäksi tapoja muistutellaan mieliin Vihreä lippu -laulun muodossa.

Pernontien laulu Meillä Pernontiel’ on hyvä jengi, ja hyvä jengi meillä on Pernontiel’, tuo lippu vihreä, on meille tärkeä, on siinä järkeä. Meillä Pernontiel’ on hyvä jengi, ja hyvä jengi meillä on Pernontiel’, me vettä säästetään, osaamme kierrättää, on yhteistyömme tärkeää. Meillä Pernontiel’ on hyvä jengi, ja hyvä jengi meillä on Pernontiel’, metsät ja eläimet, ystävät, tuttumme, on meidän juttumme. Meillä Pernontiel’ on hyvä jengi, ja hyvä jengi meillä on Pernontiel’, tää joukko vallaton, on voima verraton, kaik’ ystäviä on.