Ohjelman vaikuttavuutta on tutkittu. Tulosten mukaan ympäristökuormitus vähentyi merkittävästi Vihreän lipun toimintakulttuurin myötä.

Vesi
Veden kulutusta on onnistuttu vähentämään merkittävästi, jotkut ohjelman osallistujat ovat saavuttaneet jopa yli 40 prosentin vähennyksen. Veden käyttöä on vähennetty mm. opettelemalla uusi käsienpesutapa, syömällä lautanen puhtaaksi, uudistamalla siivousmenetelmiä sekä korjaamalla vuotavat hanat.

Energia
Energiankulutusta useat päiväkodit, koulut ja oppilaitokset ovat pystyneet vähentämään yli kymmenen prosenttia. Vähennykset on saavutettu mm. sammuttamalla turhat valot ja turhaan päällä olevat laitteet, tehostamalla tuuletusta ja laskemalla huonelämpötilaa.

Jätteiden vähentäminen
Kaatopaikalle vietävät jätemäärät ovat pienentyneet huomattavasti kaikissa ohjelmaan osallistuneissa päiväkodeissa, kouluissa ja oppilaitoksissa harkitun kuluttamisen, uudelleenkäytön ja lajittelun seurauksena.

Lähde: Katriina Sahlberg: Pro gradu -tutkielma, Helsingin yliopisto 2004.